太原市疾控中心在原太原市卫生防疫站(1957年3月成立)的基础上,于2002年6月重新组建，是直属于太原市卫生局的市级卫生事业单位。地址位于新建南路89号，现有工作用房5960平方米，其中实验室用房2400平方米。中心的主要工作职能：承担太原市的疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康教育与健康促进、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、技术管理与应用研究指导等职能。中心内设29个职能和专业业务科室，现有人员编制207人，其中卫生技术专业人员占总人数的82%，高级职称40人，中级职称66人。中心拥有原子吸收仪、气相色谱仪、液质质联用仪、液相色谱仪、原子荧光光谱仪、全自动微生物检测仪、高千伏X光车等万元以上大型检测仪器设备50余台。2018年，中心实验室固定资产达6734万元，较2012年增长了9.5倍，实验室检测能力处于全省领先位置。太原市疾病预防控制中心是太原地区疾病预防控制、卫生检验、性病艾滋病监测、卫生技术培训、公共卫生应急体系的技术指导中心，太原市二十家工程技术中心之一，山西医科大公共卫生学院的教学基地和上海复旦大学公共卫生学院太原科研教学基地，国家环境与健康疾病监测试点之一。2015年5月,与中国工程院院士、国家传染病预防与控制重点实验室主任徐建国合作建立了太原市疾控中心院士工作站，成为我省首家病原学微生物院士工作站，实现了我省公共卫生系统院士工作站零的突破。资质（认证、认定、认可）情况：◎1993年通过计量认证评审，1998年和2004年通过复审；◎1998年6月通过科技事业单位档案管理国家二级评审；◎2003年6月、12月分别取得山西省职业病诊断、职业健康监护、放射工作人员健康体检和山西省职业卫生技术服务资质；◎2004年11月在全省疾控系统率先通过中国实验室国家认可委的认可。目前，太原市疾控中心通过中国合格评定国家认可委认可12类、199项。通过山西省质量技术监督局计量认证9大类，16小类234个参数；食品资质认定:33大类，84小类，185个参数。